無形資產的理論基礎研究和組織建設尚需提升。例如，對無形資產的定義、內涵與外延的定義、歸類特點等還存有著“三特點說”、“八特點說”等不一樣見解;在商譽會計中，法律學、社會經濟學和財務會計行業均對信譽的定義明確提出了不一樣的定義;在自創信譽和負商譽的確定與計量中，自創信譽應否確定、可否計量這些仍存有不一樣叫法。在操作過程全過程中，關鍵有下列好多個難題：
一是對無形資產的計量和結轉管理體系有悖財務核算的普遍性和時效性標準。以自創商稱為例，在我國現行標準的企業會計準則要求，企業信譽僅有在企業企業并購主題活動和實生物給予確定，其金額是買家企業所付款的所有合同款超出賣家企業或被合拼企業資產總額賬面價值價錢的差值。企業平常不計量信譽，在企業并購時才對信譽開展計量的作法背馳了財務核算的基本準則，造成財務信息的比較嚴重失幀。另外，自創無形資產與購買無形資產的入帳方式不一樣，造成無形資產中間帳面價值不一樣，但現行標準的財務核算企業對自創無形資產以簡單方式開展結轉，顯而易見已不適合局勢發展趨勢的必須。除此之外，無形資產獲得前產生的研發支出是記入企業本期的管理花費的，這便會減少本期的盈利水準，危害企業的生產運營業績考核，不利鼓勵企業和員工進行自主創新。
二是政策方針要求對無形資產的評估值與認繳出資額中間的關聯定義不一樣。《中國冶金報》發布的《企業改制評估增值的認定處理方式應統一》(詳細二0一二年4月27日A3版)一文，將與改革評估有關的各種各樣要求開展了集中化核對，從這當中能夠看得出有關部門在定義上的差別與不一樣。國有資本管控組織 覺得應將財產的評估值所有做為公司股東的注資，《公司法》的有關描述也適用這種作法，但稅收單位覺得應以財產評估值扣減企業所得稅后的一部分做為公司股東的注資。
三是在企業改革的操作過程階段，驗資報告組織 、公司股東、工商局管理等單位對無形資產的了解和處理方法不盡相同。另外，無形資產的評估升值一部分存有著改革企業和投資人不在另外點交納企業所得稅的狀況，這在一定水平上存有著雙向繳稅的難題。之上不一樣和從而產生的組織建設不標準、操作流程不一致，給統一和加強無形資產管理產生了不良影響。在這些方面，有關部門和企業要產生規范性的定義規范和相對的管理規章制度，逐漸保證無形資產管理有形化化。
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